Несмотря на то, что курсанты первый год военной службы проходят службу по призыву, между ними и обычными военнослужащими по призыву есть одна существенная разница - курсанты сами приняли решение выбрать военную стезю, соответственно, они целеноправленно готовились к военной службе. Более того, курсанты имеет право в любой момент отказаться от прохождения службу путем отчисления из учебного заведения, однако при этом в счет службы по призыву идет два года учебы в военном учебном заведении. Указанное привело к тому, что срок службы курсанту по призыву может превышать установленную п. "д" ч. 1 ст. 38 Федерального закона от 28.03.1998 г. № 53-ФЗ "О воинской обязанности и военной службе. Так практически все курсанты по призыву служат более одного года, в результате чего не дополучают денежное довольствие за срок службы, превышающий один год, так как суммы, подлежащие выплате курсанту, существенно выше, чем суммы, подлежавшие выплате военнослужащему по призыву.
Более того, курсант, прослуживший менее двух лет и отчисленный из военного учебного заведения, будет вынужден дослуживать службу по призыву.
Общественное движение "Совесть Закона" проводит работу по изменению законодательства с целью обеспечения равных прав курсантов (см. раздел "Проекты движения").

При этом курсанты являются самой незащищенной категорией военнослужащих, что связано с тем обстоятельством, что в случае отчисления из военного учебного заведения по недисциплинированности, неуспеваемости или нежеланию учиться, они будут вынуждены возмещать средства федерального бюджета, затраченные на их военную подготовку. Так, согласно п. 7 Федерального закона от 28 марта 1998 г. № 53-ФЗ "О воинской обязанности и военной службе" "Граждане, отчисленные из военных профессиональных образовательных организаций и военных образовательных организаций высшего образования или военных учебных центров при федеральных государственных образовательных организациях высшего образования за недисциплинированность, неуспеваемость или нежелание учиться либо отказавшиеся заключить контракты о прохождении военной службы, а также граждане, окончившие указанные образовательные организации и уволенные с военной службы ранее срока, установленного контрактом о прохождении военной службы, по основаниям, предусмотренным подпунктами "д", "е", "е.1" и "з" пункта 1, подпунктами "в" и "д" пункта 2 статьи 51 настоящего Федерального закона, возмещают средства федерального бюджета, затраченные на их военную или специальную подготовку. Указанные граждане не возмещают средства федерального бюджета, затраченные на обеспечение исполнения ими обязанностей военной службы в период обучения. Порядок исчисления размера возмещаемых средств определяется Правительством Российской Федерации".

К наиболее распространенным нарушением прав курсантов относятся:

1. Лишение курсантов права на отдых.
В соответствии с законодательством продолжительность служебного времени военнослужащих по контракту, включая курсантов, должна составлять 40 часов в неделю (см. раздел "Права военнослужащих"). Фактическая же продолжительность служебного времени курсантов существенно выше. Все переработки должны фиксироваться в журнале учета служебного времени, однако для курсантов в отдельных военных учебных заведениях они не ведутся. В случаях переработки курсанту должны предоставляться сутки отдыха за каждые восемь часов переработки, однако это, как правило, не выполняется.
Общественное движение "Совесть Закона" осуществляет защиту права курсантов на отдых (см. раздел "Проекты движения").

2. Запрет на выбор места пребывания и жительства (право жить не в общежитие).
Большинство курсантов, заключивших контракт, проживают в общежитии. Им в исключительных случаях (обычно для женатых) разрешают жить вне общежития. Это прямо нарушает конституционные права курсантов, предусмотренные частью 1 статьей 27 Конституции РФ, согласно которой "Каждый, кто законно находится на территории Российской Федерации, имеет право свободно передвигаться, выбирать место пребывания и жительства". Данная норма нашла свое подтверждение в статье 1 Закон РФ от 25.06.1993 г. № 5242-1 "О праве граждан Российской Федерации на свободу передвижения, выбор места пребывания и жительства в пределах Российской Федерации", согласно которой "В соответствии с Конституцией Российской Федерации и международными актами о правах человека каждый гражданин Российской Федерации имеет право на свободу передвижения, выбор места пребывания и жительства в пределах Российской Федерации.
Ограничение права граждан Российской Федерации на свободу передвижения, выбор места пребывания и жительства в пределах Российской Федерации допускается только на основании закона".

Вместе с тем закона, ограничивающего право курсантов на выбор места пребывания и жительства, не существует. Оно установлено п. 244 Уставом внутренней службы Вооруженных Сил Российской Федерации, согласно которой "Увольнение курсантов из расположения военной профессиональной образовательной организации, военной образовательной организации высшего образования до заключения с ними контракта о прохождении военной службы осуществляется в порядке, установленном для солдат и сержантов, проходящих военную службу по призыву. Курсанты после заключения контракта о прохождении военной службы, а также курсанты, имеющие право проживания в общежитии, могут находиться вне расположения военной профессиональной образовательной организации, военной образовательной организации высшего образования после учебных занятий и обязательных часов самостоятельной работы, определенных распорядком дня, до 24 часов, семейные курсанты - до начала занятий следующего учебного дня".
При этом Устав внутренней службы Вооруженных Сил Российской Федерации утвержден Указом Президента РФ от 10.11.2007 № 1495 "Об утверждении общевоинских уставов Вооруженных Сил Российской Федерации" Однако, согласно ч. 3 ст. 90 Конституции РФ "Указы и распоряжения Президента Российской Федерации не должны противоречить Конституции Российской Федерации и федеральным законам".
Следовательно, имеет место противоречие между п. 244 Устава внутренней службы РФ и ч. 1 ст. 27 Конституции РФ.
Общественное движение "Совесть Закона" занимается защитой прав курсантов на выбор места пребывания и жительства (см. раздел "Проекты движения").

3. Лишение курсантов части продовольственного обеспечения (полноценного питания).
Постановлением Правительства РФ от 29.12.2007 № 946 "О продовольственном обеспечении военнослужащих и некоторых других категорий лиц, а также об обеспечении кормами (продуктами) штатных животных воинских частей и организаций в мирное время" определены нормы питания военнослужащих, включая курсантов. Однако, если сравнить указанные нормы с фактическими данными, то имеют место случаи несоответствия. В столовых должно вывешиваться меню, однако в некоторых случаях оно либо вообще не вывешивается, либо не соответствует тому, что фактически дают, либо один выриант меню вывешивается в столовой, другой вариант, указывается в документах. В отдельных случаях курсантов вообще лишают ужина и питания в выходные и праздничные дни. Как с этим бороться указано в разделе "Концепция защиты прав"
Общественное движение "Совесть Закона" занимается защитой продовольственного обеспечения курсантов (см. раздел "Проекты движения").

4. Лишение курсантов части денежного довольствия. В отдельных военных учебных заведениях имеют место случаи, когда с курсантов под различными предлогами, часть из которых замаскированы под благовидные цели, собирают денежные средства, например, на обустройство и ремонт аудитории (класса), праздники и дни рождения руководству, индивидуальные шкафчики, писчую бумагу и т.д. В некоторых случаях требуют принести строительные материалы, инструменты, инвентарь, заправит картридж и др. Одной из форм лишения денежного довольствия курсантов является запрет вышестоящих командиров (начальников) на обращение с заявлением в правоохранительные органы в случаи краж денежных средств (наличных или с пластиковой карты), а также иного личного имущества. Все указанные действия являются незаконными.